宇宙重启后的祥和不过是表象，沈梦璃的万象档案馆突然响起刺耳的警报，量子传感器捕捉到宇宙暗面传来诡异的波动。全息投影中，那座暗紫色水晶沙漏清晰可见，每一粒沙的流逝都对应着一个文明的诞生与消亡，而沙漏的底部，隐约浮现出无数双泛着幽光的眼睛。“这不是自然现象，”她的手指在数据屏上飞速滑动，“是某种超越维度的观测机制在强行制造文明轮回！”
林羽的终焉裁决者在剑鞘中剧烈震颤，剑身渗出银色液体，在空中凝结成初代观测者的残破虚影。“沙漏是‘观测者新生计划’的核心，”虚影的声音断断续续，“他们...在筛选完美文明的样本...”话音未落，虚影被一股无形力量击碎，宇宙空间突然出现无数裂缝，从中涌出的暗紫色雾气所到之处，文明的科技与记忆被迅速吞噬。
伊璇的世界树在暗紫色雾气侵蚀下，树皮裂开细密的纹路，渗出黑色汁液。树灵的意识变得狂乱：“这些雾气是被污染的混沌能量...它们在改写种子的基因代码！”她紧急将共生体融入树根，试图激活树的防御机制，却发现世界树的根系早已与沙漏的能量网络悄然相连。
阿岚的维度灯塔在宇宙深处闪烁不定，光明与黑暗的能量开始失衡。她通过灯塔的光束扫描，发现多个平行宇宙出现异常折叠，无数个“自己”正在沙漏的影响下，被迫成为观测者的傀儡。银色面具孩童的声音再次在她脑海响起：“姐姐，这次你还要反抗吗？所有的挣扎，不过是为沙漏增添新的沙粒。”
洛凛的命运熔炉内，新生守护者的训练被突如其来的幻象打断。学员们看到自己未来成为独裁者、毁灭者的画面，信任体系濒临崩溃。洛凛挥舞宿命之刃劈开幻象，刀刃却在接触暗紫色雾气时出现裂痕：“不要被虚假的未来迷惑！我们守护的是当下的选择！”
雷掣的机械军团在巡逻时遭遇新型敌人——由暗紫色水晶与文明残骸融合而成的“熵砂傀儡”。这些傀儡不仅能吸收攻击能量，还会释放出干扰量子核心的脉冲波。雷掣将军团的武器系统改造成“熵砂分解器”，在战斗中意外发现傀儡体内残留着初代观测者的实验日志片段，其中赫然写着：“文明的进化，需要不断的毁灭与重生。”
全宇宙文明联合议会再次陷入分裂。激进派主张用全力摧毁沙漏，哪怕引发宇宙震荡；保守派提议与新观测者谈判，以换取生存空间；而中立派则试图寻找第三条道路，在沙漏的规则下谋求文明的自由发展。三方争执不下之际，暗紫色雾气突然加速扩散，无数文明的星球开始玻璃化，表面浮现出沙漏的纹路。
沈梦璃在档案馆深处找到初代观测者的终极备份意识。意识体投影出一幅震撼画面：在某个遥远的维度，存在着“观测者议会”的总部，那里漂浮着数以万计的沙漏，每个沙漏都对应着一个宇宙的实验场。“你们面对的，不过是冰山一角，”意识体的声音充满无奈，“但或许...可以利用沙漏的规则...”
林羽带领守护者们兵分多路。他与沈梦璃潜入沙漏的能量网络，试图找到控制中枢；伊璇在世界树的核心寻找对抗污染的方法；阿岚穿梭于平行宇宙，解救被操控的“自己”；洛凛和学员们在现实战场构筑防线；雷掣则带领机械军团分析熵砂傀儡的弱点。
当林羽和沈梦璃接近沙漏核心，发现那里竟坐着一个与林羽容貌相似的存在，对方手持水晶权杖，正在拨动沙漏的流速。“欢迎来到终局，”观测者新首领冷笑着，“你们以为重启宇宙就能摆脱观测？从文明诞生的那一刻起，就注定是实验品。”他挥动权杖，沙漏开始疯狂旋转，宇宙中的暗紫色雾气凝结成实体巨手，向守护者们抓来。而此时，伊璇的世界树突然绽放出诡异的紫色花朵，每一朵花都代表着一个即将被抹杀的文明……