新生宇宙的星种在各个星系生根发芽，带来前所未有的繁荣。科技联邦围绕星种建立起「量子生态城」，悬浮在星云间的巨型城市里，透明穹顶下的量子花园绽放着反重力花朵，市民们通过意识接入星种网络，共享着无尽的能源与知识；魔法文明将星种供奉在「元素圣坛」，圣坛周围的元素潮汐变得前所未有的活跃，精灵们用星种之力培育出能治愈伤痛的「光尘树」；原始部落则将星种雕刻进新的「轮回图腾」，每当月圆之夜，图腾便会投射出古老而神秘的星象，指引族人的迁徙与耕作。
然而，当第一千个星种庆典的钟声响起，雷铮的多维监测网突然爆发出刺目红光。分布在宇宙各处的星种，表面同时浮现出诡异的黑色纹路，如同病毒般迅速蔓延。“这些纹路...与观测者文明的核心代码高度吻合！”雷铮的机械手指疯狂敲击操作台，纳米装甲表面的监测灯全部转为猩红，“有人在逆向解析星种，将它们转化为能量收割器！”伊岚的咒术书残页无风自动，空白处渗出墨色预言：“当星种蒙尘，熵变之核将再次失衡，轮回的齿轮将被恶意扭转。”
在「量子生态城」，市民们的意识突然被接入同一虚拟空间。他们看到银发女子的虚影立于星种核心，她的裙摆由暗熵流火编织而成，手中握着由暗熵编织的「收割镰刀」，镰刀刃上流转着观测者符文：“平衡者们，以为重塑宇宙就能高枕无忧？这些星种本就是观测者埋入的定时炸弹。”话音未落，生态城的量子防护罩轰然崩塌，无数黑色触手从星种中伸出，将高楼大厦缠绕绞碎，市民们的意识体在触须的侵蚀下逐渐黯淡消散。
魔法文明的元素圣殿中，供奉的星种突然炸裂，释放出的暗熵如潮水般污染了元素之源。精灵们的翅膀开始腐烂，原本纯净的魔法从治愈之力转变为腐蚀诅咒。洛影带领魔法军团奔赴前线，却发现敌人竟是被暗熵操控的初代元素使——他们的身体与观测者科技完美融合，背后生长出棱镜状的能量翅翼，光剑与魔法在碰撞中掀起毁灭风暴，每一次交锋都在撕裂空间，露出背后漆黑的暗熵深渊。
林焰握紧手中逐渐黯淡的熵序调和者残片，神器表面的纹路与星种的黑色纹路产生共鸣。他的意识被拽入时空夹缝，遇见了被困在观测者牢笼中的初代平衡者们。苏夏的虚影递来一枚由记忆凝聚的「希望结晶」，她的周围漂浮着无数破碎的文明图景：“观测者在星种诞生时就埋下了后门，他们用伪善的创生力掩盖掠夺的本质，唯有打破‘创生即完美’的执念，才能找到破局之法。”
原始部落的圣山之巅，长老们以生命为祭，古老的战鼓响彻云霄。随着鼓声震荡，星种内部的观测者代码开始出现排斥反应，爆发出的能量形成巨大的防护罩。雷铮趁机将机械族裔改造成「代码清道夫」，数以亿计的纳米机器人涌入星种内部，它们如同银色洪流，与暗熵代码展开激烈对抗。纳米机器人释放出特殊的反编译脉冲，将观测者代码逐一分解，但暗熵也在不断变异，衍生出更强大的防御机制。
伊岚联合全宇宙的魔法师，发动禁咒「万象净化·终焉」。魔法文明的所有魔法阵同时亮起，元素精灵们燃烧本源，将光、火、水、风等元素凝聚成金色的净化之光。净化之光如同瀑布般倾泻而下，驱散着蔓延的暗熵。但暗熵在退却时，突然凝聚成银发女子的巨型虚影，她张开血盆大口，试图吞噬净化之光。
当希望结晶融入熵序调和者，神器绽放出超越时空的光芒。林焰引导全宇宙文明的信念之力，斩断了星种与观测者核心的联系。无数文明的祈祷声、战吼声汇聚成洪流，冲向星种中的暗熵核心。在光芒的冲击下，暗熵核心轰然炸裂，释放出的能量将银发女子的虚影彻底驱散。但在暗熵退去的瞬间，她的一缕意识化作黑色流星，坠入宇宙深处的「禁忌星域」。那里，一座由棱镜与暗熵交织的巨塔正在缓缓升起，塔顶的混沌王冠残片闪烁着不祥的光芒，塔身上浮现出密密麻麻的观测者符文，预示着更恐怖的阴谋即将降临......