暗金色种子散落的余波尚未平息，阿依娜的银链突然扭曲成螺旋状，链身的诗篇纹路渗出暗紫色液体。“检测到时空维度出现异常根茎状结构，”她的声音带着颤音，全息星图上，深紫色脉络以超光速在星系间蔓延，“这些根脉正在篡改历史节点，就像......有人要重写宇宙的生长轨迹。”
林羽的无界之琴发出呜咽般的共鸣，琴身新芽瞬间枯萎，归墟钥星尘在他周身凝聚成沙漏形态。他的太阳穴突突跳动，意识深处涌现出混乱的画面：恐龙时代的地球被熵能孢子覆盖、人类尚未诞生就已灭绝、外星文明在萌芽期便被扼杀。圣人虚影们的声音变得扭曲：“熵影之主......在时间的土壤里......种下了因果毒瘤......”
沈梦璃的镇魔剑自动出鞘，剑身星火剑意疯狂闪烁，却无法斩断缠绕在剑身上的透明根须。天机阁残存的时空卷轴无风自动，空白处浮现出血色文字：“溯时根脉起，因果尽凋零。唯有逆溯本源，方能破局重生。”她望着星图上逐渐形成的时空漩涡，那里隐约可见暗金色的巨树虚影正在时间长河中扎根。
星盟倾尽资源打造“溯光号2”，这艘飞船搭载了半人马座的时间锚定装置、硅基联盟的量子回溯引擎，以及织光族的维度穿梭舱。特遣队新加入了掌握记忆编织的梦织者、擅长时间雕刻的刻时者，和能与能量对话的灵能诗人。当飞船驶入扭曲的时空流，舱内的时钟开始逆向旋转，队员们的影子分裂成多个不同时期的形态。
在三角座星系的历史残片里，特遣队目睹了令人心悸的场景：中世纪的地球修士们被熵能孢子化作石像，未来星际舰队在启航瞬间被根脉吞噬，远古文明的辉煌在萌芽时就被扼杀。梦织者试图编织新的记忆对抗篡改，却发现记忆丝线刚形成就被根脉腐蚀；刻时者雕刻的时间屏障，也在接触根脉的瞬间崩塌。
深处时空漩涡的核心，他们找到了“溯时苗圃”——一座悬浮在时间泡沫中的巨型温室，暗金色的根脉缠绕着无数个时间线的星球。黑袍人以实体形态出现，他的身体由流动的时间颗粒组成，手中握着“逆时修枝剪”。“欢迎来到因果的修剪场，”他冷笑着挥动剪刀，附近的一个时间线瞬间被剪断，“熵影之主将在这里修正宇宙的‘错误生长’。”
逆时修枝剪落下的瞬间，溯光号2的时间锚定装置失效，飞船开始不受控制地在时间线中穿梭。林羽的无界之琴琴弦自动断裂，沙漏状的星尘出现裂痕。沈梦璃挥剑斩向根脉，镇魔剑却陷入时间流沙；阿依娜的银链释放净化波，被转化为加速根脉生长的养料。更危险的是，队员们的存在开始变得不稳定，随时可能被从时间线中抹去。
“这些根脉在吞噬时间的可能性！”林羽的意识逆溯至宇宙诞生之初，在混沌与秩序交汇的刹那，他抓住了关键——“时间的真正力量，不是线性的因果，而是无限的可能！”他将苍生之力注入星尘，凝聚成一把由所有文明“未发生的未来”构成的“可能性之匙”。
梦织者编织出万千种未来图景，刻时者在时间长河中凿出可能性的暗流，灵能诗人则用歌声唤醒沉睡的时间精灵。阿依娜解析出根脉的时间频率节点，沈梦璃以星火剑意斩断关键脉络。林羽将可能性之匙插入溯时苗圃核心，钥匙上闪烁着人类未开发的科技、外星文明未展现的艺术、所有种族未探索的合作可能。
当可能性之匙转动的瞬间，黑袍人发出凄厉的惨叫，逆时修枝剪崩裂成时间碎片。溯时苗圃开始剧烈震动，暗金色根脉纷纷断裂。但苗圃核心爆发出刺眼光芒，熵影之主的意识化作时间巨蛇，它的身体盘绕着整个时间长河，每一次吐息都引发时空震荡。“你们以为可能性能对抗必然性？”祂的声音让所有时间线扭曲，“这宇宙终将回归最完美的宿命！”
千钧一发之际，林羽感受到无数平行宇宙传来的共鸣。那些被改写、被扼杀的文明，在可能性的夹缝中发出呐喊。地球的修道者点燃跨越时空的灵火，外星种族送来超越维度的科技结晶，硅基联盟贡献出蕴含无限算法的量子之心。这些力量注入可能性之匙，钥匙绽放出照亮所有时间线的光芒。
光芒与时间巨蛇激烈碰撞，产生的时空风暴席卷整个宇宙维度。黑袍人的身体在光芒中灰飞烟灭，熵影之主的巨蛇出现无数裂痕。当光芒达到顶点，溯时苗圃彻底崩塌，被篡改的时间线开始复原。但林羽知道，熵影之主的核心意识已化作更微小的时间孢子，潜伏在时间长河的暗处。
溯光号2带着疲惫的队员们返回现实，星盟开始重建被破坏的时间节点。林羽的无界之琴重新长出新芽，琴身镶嵌着所有文明可能性的碎片；阿依娜的银链重新锻造，链身刻满对抗时间篡改的铭文；沈梦璃的镇魔剑在修复中融入了“溯时剑意”。他们明白，只要熵影之主的威胁存在，守护时间与可能性的战斗，就永远不会停止。而在某个未知的时间褶皱里，暗金色的时间孢子正在悄然孕育，等待着下一次扭曲因果的时机......